#!/bin/csh
#
mkdir 1-Ante-RED
cp Ante_RED.pl AIB-Conf*.pdb Methylammonimum.pdb Acetate.pdb 1-Ante-RED
cd 1-Ante-RED
touch Ante_RED.log
# Ante_RED.pl is executed four times
foreach PDBFILE (*.pdb)
  perl Ante_RED.pl $PDBFILE >> Ante_RED.log
end
rm Ante_RED.pl
cd ..
echo " Ante_R.E.D. execution done... "